Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms