Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NfkbiaQ9Z1E3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NfkbiaQ9Z1E3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms