Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Setbp1Q9Z180 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Setbp1Q9Z180 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms