Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms