Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup160Q9Z0W3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms