Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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