Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp2Q9Z0E6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms