Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms