Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katna1Q9WV86 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms