Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms