Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VapaQ9WV55 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VapaQ9WV55 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VapaQ9WV55 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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VapaQ9WV55 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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VapaQ9WV55 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapaQ9WV55 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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