Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms