Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Opn3Q9WUK7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms