Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms