Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn4Q9WU22 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn4Q9WU22 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms