Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms