Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sae1Q9R1T2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sae1Q9R1T2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms