Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Chst4Q9R1I1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Chst4Q9R1I1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms