Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms