Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms