Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc3Q9R0B6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms