Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d3cQ9QZS8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms