Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Col4a3Q9QZS0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Col4a3Q9QZS0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a3Q9QZS0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms