Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Col4a4Q9QZR9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a4Q9QZR9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a4Q9QZR9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Col4a4Q9QZR9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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