Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afyQ9QZQ8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afyQ9QZQ8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms