Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms