Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr2e3Q9QXZ7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms