Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms