Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc5Q9QX29 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms