Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms