Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms