Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thsd1Q9JM61 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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