Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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