Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cabp1Q9JLK7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms