Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Tmod4Q9JLH8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod4Q9JLH8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod4Q9JLH8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod4Q9JLH8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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Tmod4Q9JLH8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms