Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlr5Q9JLF7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms