Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms