Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FancaQ9JL70 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms