Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms