Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms