Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrac1Q9JKP8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrac1Q9JKP8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms