Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms