Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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