Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms