Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms