Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scube2Q9JJS0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scube2Q9JJS0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms