Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms