Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI0

Mmp19, Matrix metalloproteinase-19, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp19Q9JHI0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp19Q9JHI0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms