Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn12Q9ET43 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn12Q9ET43 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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