Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn19Q9ET38 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn19Q9ET38 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn19Q9ET38 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn19Q9ET38 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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